水崇拜也是藏族先民原始自然崇拜的重要组成部分。
青藏高原上的湖泊星罗棋布,藏北一带的大小湖泊千余个,总面积达30000平方公里。青藏高原还是我国许多著名江河的发源地,如:雅努藏布江、金沙江、怒江、黄河、澜沧江等都纵横乎发源于青藏高原。青藏高原上的藏族先民居住在这样一个水资源如此丰富的环境,这与他们的生活和生产都 有直接关系。伴随着湖水的涟漪和河水的流淌,对水的崇拜在不知不觉间形成。
藏族先民把湖泊中的水看成是天神赐予人间的“圣水”,一旦饮用这些湖泊中的水或在这些湖泊中沐浴,就会祛病、除灾、延寿等。所以,藏族先民就把这些湖泊称为“神湖”或“圣湖”。为了求得“圣水”和“神水”赐予他们平安与福祉,藏族先民们就对这些湖泊进行祭拜。藏族著名的神湖有玛旁雍错、纳木错、雍错赤宿甲摩(即青海湖)等,每一个神湖都有各自的传说和特定的神灵。